Το Π.Μ.Σ. λειτουργεί με τα νόμιμα διοικητικά όργανα τα οποία είναι:
α) ο Διευθυντής του Μεταπτυχιακού: Ευάγγελος Χρήστου (Καθηγητής)
α) η Αναπληρώτρια Διευθύντρια του Μεταπτυχιακού: Χρυσούλα Χατζηγεωργίου (Αναπληρώτρια Καθηγήτρια)
β) η Συντονιστική Επιτροπή του Π.Μ.Σ.: Ευάγγελος Χρήστου (Καθηγητής), Φώτης Κιλιπίρης (Καθηγητής), Τάνια Καπίκη (Καθηγήτρια), Χρυσούλα Χατζηγεωργίου (Αναπληρώτρια Καθηγήτρια), Σάββας Μαυρίδης (Αναπληρωτής Καθηγητής)
γ) η Συνέλευση του Τμήματος Διοίκησης Επιχειρήσεων του Αλεξάνδρειου Τ.Ε.Ι. Θεσσαλονίκης
δ) η Επιτροπή Μεταπτυχιακών Σπουδών του Αλεξάνδρειου ΤΕΙ Θεσσαλονίκης που απαρτίζεται από τα εξής μέλη ΔΕΠ: Παναγιώτης Αδαμίδης (Καθηγητής, Αντιπρύτανης Αλεξάνδρειου ΤΕΙ Θεσσαλονίκης), Ευάγγελος Χρήστου (Καθηγητής, Κοσμήτορας Σχολής Διοίκησης & Οικονομίας), Κυριάκος Καζάκος (Καθηγητής, Κοσμήτορας Σχολής Επαγγελμάτων Υγείας & Πρόνοιας), Γεώργιος Μπάμνιος (Καθηγητής, Κοσμήτορας Σχολής Τεχνολογικών Εφαρμογών), Πέτρος Σαμαράς (Καθηγητής, Κοσμήτορας Σχολής Γεωπονίας & Τροφίμων).